SimVector(质粒图谱绘制工具)v4.6.0官方版
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详情介绍
SimVector是一款质粒图谱绘制工具,支持绘制各种图案、颜色、字体和类型的圆形和线性矢量图。它还拥有多种绘图工具,方便用户使用,如有需要可以下载。
SimVector是一款质粒图谱绘制工具,支持绘制各种图案、颜色、字体和类型的圆形和线性矢量图。它还拥有多种绘图工具,方便用户使用,如有需要可以下载。
特征
1. 计划克隆实验
1. 设计Gateway 克隆实验:使用SimVector,您可以执行构成Gateway 的BP 和LR 反应?克隆。 BP 反应和入门克隆的生成需要供体载体和表达载体。 LR 反应和表达载体的生成需要入口载体和目标载体。
2.设计TA克隆载体:SimVector可以轻松设计TA克隆实验。 TA 克隆向导接受商业T 载体或限制性设计的T 载体,并将它们与修饰的PCR 产物组合。然后您可以生成高度准确的重组DNA 质粒图谱。
3. 进行限制性克隆:克隆技术需要限制性内切酶对载体分子和待克隆分子进行切割。 SimVector 执行限制性酶分析,并允许您在所需序列上过滤、注释和绘制限制性酶。
4. 进行限制性分析:使用包含1,000 多种限制性内切酶的综合数据库进行限制性分析。 SimVector 识别DNA 序列中的限制性内切酶识别位点并用于确定限制性内切酶。提供两种酶过滤模式来指定限制性分析的参数。酶过滤使您能够设置酶标准来满足您的实验要求。为了您的方便,其中包含来自20 多家商业供应商的酶试剂盒。
2. 绘制目录质量质粒图谱
1. 绘制质粒图谱:使用SimVector 绘制出版质量的质粒图谱。
2. 多克隆位点(MCS)显示:SimVector 通过解释GenBank 头文件注释(可用)来识别MCS,也可以手动指定。
3. 支架视图显示:它甚至可以聪明地仅列出在MCS 和其他地方切割的酶。这种特殊的格式称为“括号视图”。
4. 目录质量矢量图形:SimVector 生成矢量图形格式的质粒图,以便导出到Adobe Illustrator 10 和Microsoft PowerPoint 2002。
5. 导出网络就绪图像:以JPEG、PNG 和TIF 格式导出高分辨率质粒图像,以便轻松添加到网站,并导出托管页面的图像。
6.图形Entrez功能:将GenBank注释转换为图形特征(线性和圆形序列图)。
7. 创建向量:在不知道其顺序的情况下创建矢量图。
3. 定制矢量图
1. 简单样式:从数百种字体、颜色、样式和填充图案中选择一个按钮,用于限制性内切酶和功能。
2. 颜色主题:定义您自己的自定义颜色主题并重复应用。
3. 选取框:将选定的对象分组,快速设置所有样式。
4. 线性和圆形视图:显示圆形和线性质粒图。
5. 缩放:放大以查看详细图形或获得概览。
6. 文本:添加文本来注释质粒图谱。
软件特点
1. 绘制优秀发表质量的质粒图谱
无论您是销售工程质粒的目录公司还是对重组克隆实验进行限制性分析,SimVector 都将帮助您模拟实验并从头到尾创建出版质量的质粒图谱。使用该软件以各种颜色、图案、字体和线型绘制圆形和线性质粒图。酶名称以两种字体样式显示,细菌部分以斜体字显示,与传统字体一样。只要质粒图中包含特征注释,就可以在单个文本单词中使用多种字体样式和颜色。
2. 多个克隆位点
载体目录通常以独特的格式显示MCS,其中酶在垂直列表中彼此叠置。 SimVector 通过解释GenBank 标题注释来识别MCS,或者您也可以手动指定它们。然后它们以我们称为“括号视图”的特殊格式绘制。它甚至有聪明的人只列出了在MCS 和其他地方切割的酶。
3. 闪电般的快速克隆模拟
SimVector 将GenBank 或本地文件中的序列标题中的注释转换为完整说明的图谱。克隆向导将指导您完成常用的重组方案,例如Gateway 克隆和TA 克隆,以及一种和两种酶限制性克隆。 ORF 搜索可以帮助您确保构建体保留在框架内。单击按钮即可翻译表达蛋白质的序列,以检查可能的阅读框错误。使用SimVector,克隆模拟就像单击几个按钮一样简单。
4.极限分析
SimVector 具有全面的限制性内切酶分析功能。从包含一千多种限制性内切酶的数据库中进行选择,或使用我们预装的流行商业酶库。 SimVector 还允许您构建自己的定制酶组。
5.生物学家设计的直观界面
SimVector 具有生物学家设计的直观界面,用于限制性克隆和序列分析。点击式向导使初学者也能轻松使用,而多功能功能使专家能够完全控制质粒图谱。